Bacili su vrsta bakterija koje se klasificiraju prema njihovom specifičnom obliku štapića. Bakterije su po obliku ili kuglaste (koki), poput štapića (bacili) ili spiralne (spirohete). Pravi oblik ovisi o zidu bakterijske stanice, čvrste, složene, slojevite strukture.
Premda se bakterije djelomično klasificiraju po svom specifičnom obliku, većina bakterija, uključujući bacile, klasificira se ili kao gram-pozitivne ili kao gram-negativne, ovisno o njihovoj boji nakon što se za vrijeme laboratorijskog pretraživanja primijeni bojenje zvano bojenje po Gramu. Međutim, klasifikacija bakterija kao gram-negativni ili gram-pozitivne odgovara i nekim karakteristikama bakterijskog vanjskog zida, vrste infekcija koje bakterije proizvode i po tipovima antibiotika za koje je vjerojatno da će djelovati na bakterije.